Rozevírací nabídka Režim prolnutí v sekci Vrstvy umožňuje nastavit, kolik pixelů ze zvolené vrstvy se prolne s pixely na všech vrstvách pod zvolenou vrstvou. Režimy prolnutí jsou podobné těm, které jsou k dispozici v aplikacích pro úpravy obrázků: Patří mezi ně Vícenásobný, Zeslabení barvy, Vyloučení a Sytost.