Los cambios en las preferencias de QuarkXPress se manejan de las siguientes maneras:

• Si se realizan cambios en las preferencias de la aplicación en el cuadro de diálogo Preferencias (menú QuarkXPress/Edición) con o sin proyectos abiertos, los cambios se guardan en los archivos de preferencias y afectan de inmediato a todos los proyectos abiertos y a todos los proyectos que se abran posteriormente.
• Si se efectúan cambios en los ajustes de Gestor de XTensions (menú Utilidades) con o sin proyectos abiertos, los cambios se guardan en los archivos de preferencias y afectan a todos los proyectos después de reiniciar QuarkXPress.
• Si se efectúan cambios en los ajustes de Gestor de archivos PPD (menú Utilidades) con o sin proyectos abiertos, los cambios se guardan en los archivos de preferencias y afectan de inmediato a todos los proyectos abiertos y a los que se abran en el futuro.
• Si se efectuan cambios en las preferencias de maquetación en el cuadro de diálogo Preferencias (menú QuarkXPress/Edición) con un proyecto abierto, los cambios se guardan únicamente con el proyecto activo.
• Si se elige un diccionario auxiliar diferente con un proyecto abierto, el cambio se guarda solamente con el proyecto activo.
• Si se efectúan cambios en la información de la tabla de kern, la información de la tabla de track y las excepciones a la partición de palabras en un nuevo proyecto, dichos cambios se guardan con el proyecto activo y en los archivos de preferencias.

Si aparece la alerta de Preferencias que no coinciden cuando se abre un proyecto y se hace clic en Utilizar preferencias XPress, los cambios efectuados en la información de la tabla de kern, la información de la tabla de track y las excepciones a la partición de palabras se guardarán tanto en ese proyecto como en los archivos de preferencias.